Ликвидация и увольнение

Да, это можно признать ликвидацией. Тот факт, что магазин остался — это значит, что магазин из собственности ИП перешёл в собственность ООО. ИП и ООО — с юридической точки зрения разные лица. Однако при ликвидации ваш работодатель был обязан рассчитаться с вами в соответствии с Трудовым кодексом РФ: выплатить соответствующие пособия, произвести запись в трудовую книжку, сообщить о вас в Центр занятости. Поэтому всё это вы можете потребовать исполнить через суд.