В российском консульстве не принимают заявление на выдачу загран паспорта в замен утраченого,

При подаче заявления в загранучреждение заявитель должен представить действующий загранпаспорт. в случае отсутствия, истечения срока действия допускается представление действительного внутреннего паспорта.
в случае отсутствия и этого документа загранучреждение по просьбе заявителя проводит проверку обстоятельств, свидетельствующих о наличии у гражданина, личность которого загранучреждением установлена, гражданства российской федерации.
в приеме документов отказывается в случаях:
отсутствия либо ненадлежаще оформленного какого-либо из документов, предусмотренных административным регламентом мид,
несоблюдения требования о подаче заявления лично заявителем (через законного представителя) либо законным представителем несовершеннолетнего.
вы представляли внутренний паспорт? если да, и прочие документы в порядке, то отказ в приёме заявления необоснован.