Налог на имущество (квартиру)

Исходя из смысла статьи 407 Налогового кодекса РФ:

2. Налоговая льгота предоставляется в размере подлежащей уплате налогоплательщиком суммы налога в отношении объекта налогообложения, находящегося в собственности налогоплательщика и не используемого налогоплательщиком в предпринимательской деятельности.

3. При определении подлежащей уплате налогоплательщиком суммы налога налоговая льгота предоставляется в отношении одного объекта налогообложения каждого вида по выбору налогоплательщика вне зависимости от количества оснований для применения налоговых льгот.

Если «перевести» на «гражданский» язык, смысл льготы состоит в том, что она предоставляется только на один объект налогообложения по выбору налогоплательщика. А у вас две комнаты, то есть два отдельных объекта налогообложения, поэтому вторая комната налогом облагается. Но вы можете выбрать из этих комнат бОльшую по площади, на которую вы не хотите платить налог, пойти в налоговую инспекцию с документом об инвалидности и переоформить льготу на ту комнату, которую вы выберете в качестве объекта применения льготы.